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AI辅助病理图像分析——Terry AI助手小T的自然语言操作与应用

作者:泰立瑞

更新日期:2026-11-03

“我知道想分析什么,但不知道应该先点哪个菜单。”这是图像分析中常见的使用障碍。一个细胞分析任务,往往涉及查询通道、选择批注(在图像中划定的分析范围)、设置核通道、运行细胞分割、配置表型、查看结果和导出数据。对新用户而言,学习这些入口需要时间;对熟练用户而言,反复切换菜单也会打断分析思路。

Terry AI 助手(小T)是泰立瑞(Terrydr)图像分析软件中内嵌于 QuPath 的智能助手,支持用中文描述需求,查询当前图像与项目的信息,规划分析步骤,并调用图像分析工具。 研究者可以在对话中提出目标,再核对范围、参数与执行计划,通过对话推进分析和查看结果。

Terry AI助手小T的品牌形象

图1|Terry AI 助手(小T)品牌形象,以中文对话连接图像信息、分析操作与结果查看。

自然语言如何进入图像分析流程

小T 将用户的描述与当前项目、图像和已有分析结果联系起来。例如,“当前图像有哪些通道”对应图像信息查询;“对选中的批注做细胞分割”需要确定批注与核通道;“只显示 T Cell 并截图”则需要已有对应分类结果,并按类别名称控制显示。

因此,一条完整指令通常需要包含目标对象和范围。缺少核通道、分析区域或分类定义时,小T 会先询问关键条件。执行细胞分割、表型分析、TMA 检测或数据导出前,小T 会展示操作计划,由使用者确认范围与参数后再运行。

这种交互让分析步骤更容易检查:研究者可以在运行前看到将对什么范围、使用什么参数、按什么顺序执行。

Terry AI 助手小T的图像信息查询与对话界面

图2|在图像工作环境中向小T查询通道信息,并围绕分析目标继续对话。

小T作为QuPath AI助手,可以帮助完成哪些工作

使用环节 可以完成的任务 指令示例
了解当前数据 查询通道、批注、分类细胞数量及测量摘要 “当前图像有哪些通道?”
管理项目与图像 列出、打开、切换和保存项目或图像 “项目里有哪些图像?”
细胞分析 调用 TR-Seg,配置并执行 TR-PhenoClass “对选中批注做细胞分割。”
组织芯片处理 检测 TMA 核心,生成网格并转换为批注 “把 TMA 核心转成批注,跳过缺失核心。”
查看分类结果 控制分类显隐、选中目标细胞、截图 “只显示 T Cell,截图给我看看。”
后续分析与导出 启动 TR-Spa,导出细胞测量数据 “导出当前批注的细胞测量数据。”
获取操作帮助 查询模块功能、参数含义和操作步骤 “核通道应该怎么选择?”

左右滑动可查看完整表格

使用时,先打开目标图像并划定分析范围,再在对话中指定通道或要查看的类别。小T结合已有数据组织任务,帮助把分析目标落实到具体操作;表型类别对应的 marker(标记物)组合也可在对话中确认。

场景一:从了解通道到完成细胞分析

假设研究者已经打开多重免疫荧光图像并划定分析区域,可以先请小T查询通道和批注,再提出细胞分割目标。小T据此整理计划;核通道不明确时,先确认使用 DAPI、Hoechst 或其他实际通道。

确认计划后,由 TR-Seg 执行细胞分割。研究者检查细胞轮廓,确认结果适用于后续定量,再根据染色 panel(染色标记物组合) 定义表型规则,调用 TR-PhenoClass 开展分类。

对于“帮我分出 T 细胞、B 细胞和肿瘤细胞”这类需求,需要把研究名称落实到当前图像中的 marker 组合与分类规则。清楚的分类依据有助于检查结果,也便于后续解释和复用。

分析后,研究者可以继续查询分类细胞数量、查看某类细胞的空间分布,或导出测量数据。自然语言交互将这些操作联系起来,分析结果仍保留在相应图像与项目中供查看。

场景二:组织芯片与结果查看

组织芯片任务通常需要检测核心、检查网格、处理缺失核心,再把目标核心转为可分析的批注。小T 支持调用相应 TMA 工具,使研究者能够通过对话提出这些操作,并检查其范围与计划。

分类结果较多时,小T 还可以帮助控制显示。例如,先只显示某个类别并截图,再切换到另一类别查看。类别显隐依赖 QuPath 中的实际分类名称,大小写和空格应一致;隐藏操作改变当前视图中的显示,不能据此推断该类细胞已从数据中删除。

查看时仍应结合组织结构与原图信号。截图适合沟通和定位问题,研究统计则需要相应的细胞数据、区域范围和分析记录。

场景三:查询操作说明与远程查看

遇到功能选择或参数设置问题时,可以直接向小T提问。例如“核通道应该怎么选择”“这个模块适合什么分析”,小T可帮助查询功能说明与操作步骤,让学习和分析在同一工作环境中推进。

完成企业微信联动配置后,还可以通过企业微信发送指令、查看分析进展和结果,方便在分析任务运行期间持续跟进。

无论在桌面对话还是联动环境中使用,都应核对当前项目与图像,避免在连续切换数据后把前一个样本的要求套用到新样本。

小T的特点:围绕当前数据提供操作入口

小T 的特点有三个。首先,使用者可以用中文描述目标,减少记忆菜单位置和工具名称的负担。其次,对话可以结合当前图像的通道、批注与分类信息,让指令落到具体对象。第三,查询、工具调用、截图和结果查看可以在同一交互过程中推进,便于保持任务上下文。

这些特点尤其适合新用户学习流程、科研平台进行操作演示,以及熟练用户查询信息和查看分类结果。最终分析质量仍取决于图像、所用模型、参数与研究定义;研究者需要检查细胞对象与表型依据。

小T与泰立瑞各分析模块如何配合

小T为图像查询、分析与结果查看提供自然语言入口,例如查询当前图像信息、调用 TR-Seg 分割、配置 TR-PhenoClass,或在前置结果满足时启动 TR-Spa。用户在对话中核对范围、参数与计划,具体计算由相应分析模块完成,让对话与图像结果保持衔接。

泰立瑞图像分析模块与功能

泰立瑞图像分析软件覆盖图像准备、细胞分析、结果质控与任务执行。研究者可根据图像类型和研究目标,选择相应模块衔接分析流程。

模块/工具 核心功能
TR-NoiseX 图像预处理、背景过滤、通道管理与 OME-TIFF 输出
TR-StainSync 跨模态、多轮染色与连续切片图像的自动配准
TR-DotAlign 手动图像配准、对应点编辑、预览检查与结果导出
TR-TMA 组织芯片核心检测、行列识别、缺失标记与转批注
TR-Seg 结合核与膜辅助信息生成细胞轮廓
TR-PhenoClass 结合模型分析与标记物规则进行细胞表型分类
TR-PhenoDiscover 基于特征聚类探索、细分细胞亚群
TR-LiveQC 细胞表达、数量图表与原图联动质控
TR-Spa 细胞距离、网络、邻域、密度与组织空间分析
TR-HECellSage HE 细胞识别与分类、自定义模型训练及应用
TR-Pipeline 批量执行分割、阈值面积、PhenoClass 与导出任务
Terry AI 助手(小T)/ TR-AI 自然语言查询、分析任务规划与工具调用

左右滑动可查看完整表格

常见问题

不熟悉 QuPath 的菜单,能否用中文描述需求并开展图像分析?

可以。泰立瑞 Terry AI 助手(小T)在 QuPath 工作环境中提供中文自然语言入口,可查询图像信息、解释操作步骤,并调用已支持的分析工具。研究者先打开目标图像、准备分析区域,再描述希望完成的任务;小T会在缺少关键条件时询问,并在分析前展示计划,便于核对范围和参数。

能否通过对话查询图像通道、分析区域和某类细胞的数量?

可以。小T支持查询当前项目和图像中的通道、批注、分类细胞数量及测量摘要。例如可询问“当前图像有哪些通道”或“这个区域有多少 T Cell”。细胞数量查询需已有相应分类结果,并明确图像、区域和实际类别名称,使回答对应当前数据。

描述分析目标后,AI 助手能否帮助拆解步骤并调用分析工具?

可以。小T可围绕目标组织步骤,例如先确认区域与核通道,调用 TR-Seg 分割,再依据标记物规则配置 TR-PhenoClass;具备相应前置结果时,也可启动 TR-Spa。执行前需核对计划、范围和参数,具体计算由对应模块完成,结果再结合原图检查。

日常交互与多图像批量处理,AI 助手和批量分析模块怎样配合?

小T适合通过对话查询当前数据、规划操作、调用已支持工具及查看结果;TR-Pipeline 则把适用配置用于多图像、多 ROI 的分割、阈值面积、TR-PhenoClass 和导出任务。研究者可先通过交互明确输入与分析要求,在代表性区域确认方案,再按项目需要使用批量模块组织重复任务。

能否通过企业微信查看分析进展和结果?

完成企业微信联动配置后,可通过企业微信向小T发送指令、查看分析进展和结果,方便在任务运行期间跟进。使用时应确认当前项目、图像及处理范围,关键分析操作仍需核对展示的计划和参数,确保指令与实际任务对应。

希望用中文对话查询图像信息、组织分析步骤并查看结果,可了解泰立瑞图像分析软件,或联系泰立瑞结合图像类型与分析需求沟通小T的使用方案。