细胞表型分析质控——泰立瑞TR-LiveQC的图表与原图联动

作者：泰立瑞

更新日期：2026-11-03

细胞分类或聚类完成后，研究者通常会看到类别数量、表达图和降维散点。但一个群体在图表中形成分组，还需要继续回答：它具有怎样的 marker（标记物） 特征，在组织中出现在哪里，是否混入明显不一致的对象。

TR-LiveQC 是泰立瑞（Terrydr）图像分析软件的交互式结果质量检查（质控）模块，可按分析区域（ROI）或合并数据查看表达气泡图、细胞数量、UMAP 与单细胞特征图，并将图表中的细胞选择同步到原始图像。 它帮助研究者把群体特征与组织原位位置联系起来检查。

这种联动让质控成为一项具体操作：从图中选择感兴趣对象，回到组织看它们，再依据图像与特征判断结果怎样解释。

细胞表型质控需要同时看哪些信息

对同一批细胞，类别数量、marker 特征与原始位置分别提供不同信息。数量提示群体规模，表达帮助理解类别依据，原图显示细胞所在的实际组织环境。

如果只看其中一种信息，异常可能难以解释。例如一类细胞数量偏多，可能涉及分析范围、分类规则或对象本身；需要回到图像和表达一起核查，才能定位下一步检查方向。

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从已有分析结果启动LiveQC

启动前，确认当前图像已有细胞分类结果，并建立需要检查的批注（在图像中划定的分析范围） ROI。在启动窗口选择一个或多个区域，按任务决定是否执行 UMAP、是否加载单细胞特征强度图，再启动网页。

不同图表需要的数据与计算量不同。只检查类别数量和表达概况时，可以先使用相应图表；需要观察特征空间分布或单细胞差异时，再启用对应选项。

网页默认可查看合并数据，也可以选择具体 ROI，或将多个 ROI 的图表平铺。平铺时，独立 ROI 展示气泡图、柱状图及已启用的单细胞特征图；UMAP 只在顶部合并数据区域显示。比较时应保留区域范围和数据条件，使数量与特征差异有清楚背景。

各类图表分别怎样使用

UMAP查看特征空间中的群体分布

UMAP 用于降维可视化，帮助从所用特征观察细胞之间的关系。其原始方法文献讨论的是特征数据的低维表示。UMAP 方法文献

在 LiveQC 中，启用后可查看散点、悬停信息，并通过矩形或套索选中一批细胞。图上的相近位置需要按所用特征解释，组织中的实际位置则应通过原图联动另行查看。

图1｜UMAP 按细胞类别着色，可框选或套索选择感兴趣的细胞。坐标表示特征空间中的关系。

气泡图比较类别与marker特征

气泡图的纵轴为细胞类别，横轴为特征或 marker。颜色越深表示该类别的平均特征强度越高，气泡越大表示具有相应表达的细胞比例越高。研究者可以先查看群体的 marker 特征，再选择对象回到图像检查。

读图时应核对颜色、大小和所用特征的具体含义，避免仅凭一个视觉元素认定全部细胞的生物学状态。研究者可以将异常组合与规则配置、原图信号相互对照。

图2｜类别表达气泡图，通过颜色与气泡大小比较各细胞群体的 marker 特征。

柱状图与单细胞特征图补充检查

柱状图展示类别数量，适合先了解当前范围的群体组成。单细胞特征强度图以细胞为列、特征为行，同类细胞相邻排列，颜色越亮表示强度越高；该图聚焦所选分析特征，不显示 DAPI。它可用于继续观察同一群体内部的一致性和需要单独检查的对象。

数量与特征图相互补充。比较不同 ROI 时，需要考虑分析范围与输入条件，再决定是否开展进一步的密度、比例或其他统计。

图3｜单细胞特征强度图：列为细胞、行为特征，同类细胞相邻排列，便于查看群体内部差异。

怎样把图表选择带回组织原图

气泡图或柱状图通常用于选择某个类别，UMAP 和单细胞特征图可以帮助选择更局部的对象。选中后，配套软件中的相应细胞可以同步高亮，供研究者查看组织位置与信号。

一次检查可以从明显的类别开始，再选择边界群体或疑似异常部分。回看核、膜、marker 和细胞轮廓，判断问题主要来自数据范围、分割、类别定义还是群体解释，再决定是否回到相应模块调整。

开始下一轮选择前，可以清空当前选择，避免上一次的高亮状态影响观察。界面选择用于定位和核查，应与真正修改类别或重新分析的操作区分记录。

图4｜图表选中的细胞同步到组织原图，让群体特征与实际位置对应起来。

下载图表与数据时需要知道什么

LiveQC 支持下载图表 ZIP 与细胞数据 CSV。图表可以用于整理结果，数据用于继续统计或项目归档，二者承担不同用途。

完整细胞数据下载保留完整范围，不随页面 ROI 或 Other（未归类细胞） 显示开关变化。研究者应区分“当前画面显示哪些数据”与“下载文件包含哪些数据”，打开文件核对字段和范围后再使用。

保留细胞 ID、ROI、类别、特征和分析条件，可以帮助在图表、数据表与原始图像之间追溯。项目记录还应说明使用了哪些分类或聚类结果，便于后续复核。

LiveQC的特点与实际优势

让多种信息围绕同一批对象对应。 类别、数量、表达与位置不再分散解释，研究者可以从任一视图进入同一次检查。

让群体检查落到具体细胞。 图表用于发现需要关注的群体，原图用于观察实际位置与结构。这种操作连接适合向团队说明为什么继续细分或返查某类结果。

把质控插入迭代流程。 发现问题后，可以回到表型或聚类模块调整，再重新查看结果。图表输出和数据导出帮助保留各轮分析依据。

与其他分析插件怎样形成闭环

TR-LiveQC 连接分类结果与原始图像。发现异常后，可根据问题回到 TR-Seg 检查细胞轮廓，或回到 TR-PhenoClass、TR-PhenoDiscover 调整分类与探索；核查后的类别和坐标再进入 TR-Spa，让质控同时服务上游返查与下游空间研究。

泰立瑞图像分析模块与功能

泰立瑞图像分析软件覆盖图像准备、细胞分析、结果质控与任务执行。研究者可根据图像类型和研究目标，选择相应模块衔接分析流程。

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常见问题

细胞表型分类完成后，怎样结合标记物表达和原图检查结果是否合理？

泰立瑞 TR-LiveQC 可查看类别表达气泡图、细胞数量及按需启用的单细胞特征图和 UMAP，并将选中细胞同步到组织原图。研究者可以先检查某类细胞的表达组合和数量，再回到原图核对信号、轮廓与组织位置，用于发现需要返查的分割、分类或聚类结果。

在 UMAP 中选中一群细胞，怎样找到它们在组织图像中的位置？

启动 TR-LiveQC 时启用 UMAP 计算，加载对应图像和分析区域后，即可在 UMAP 中选择感兴趣细胞，并同步到配套图像软件中的相应对象高亮。研究者可据此查看它们的原位分布、形态及标记物信号；使用时应保持当前图像与加载数据对应。

UMAP 中位置相近的细胞，在组织中也一定相邻吗？

UMAP 展示所用特征在低维空间中的关系，不能直接用图上的间距判断组织中的物理距离。TR-LiveQC 的原图联动可帮助查看这些细胞实际位于哪里；需要定量研究细胞邻近、距离或局部邻域时，可基于可靠的类别与组织坐标使用 TR-Spa。

怎样比较不同分析区域中的细胞数量和表达特征？

TR-LiveQC 可查看单个分析区域（ROI）、合并数据或多个区域的平铺图表，比较类别数量、表达气泡图及已启用的单细胞特征图。UMAP 在顶部合并数据区域显示。解释不同区域的差异时，应同时考虑区域面积、取样范围和图像条件，再决定后续的比例、密度或统计分析。

完成结果检查后，怎样导出图表和完整细胞数据？

TR-LiveQC 支持下载图表 ZIP 和细胞数据 CSV，分别用于结果展示与后续统计、归档。完整细胞数据下载范围不随页面 ROI 选择或 Other 显示开关变化；只研究某个区域时，应在文件中核对字段和范围，再筛选目标数据。保存时一并记录图像、区域及所用分析条件，便于追溯。

了解 泰立瑞图像分析软件，或结合已有分类结果与需要检查的 ROI，咨询 TR-LiveQC 演示与适用方案。

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